Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTAP01374 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LTAP01374 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LTAP01374 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTAP01374 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LTAP01374 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LTAP01374 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LTAP01374 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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