Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTAP01040 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTAP01040 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTAP01040 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSTAP01040 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSTAP01040 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSTAP01040 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSTAP01040 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSTAP01040 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSTAP01040 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSTAP01040 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTAP01040 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms