Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSD2O96028 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSD2O96028 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSD2O96028 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSD2O96028 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSD2O96028 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSD2O96028 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSD2O96028 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NSD2O96028 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NSD2O96028 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSD2O96028 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSD2O96028 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSD2O96028 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSD2O96028 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSD2O96028 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NSD2O96028 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSD2O96028 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSD2O96028 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSD2O96028 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NSD2O96028 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSD2O96028 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSD2O96028 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSD2O96028 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSD2O96028 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSD2O96028 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSD2O96028 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSD2O96028 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSD2O96028 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSD2O96028 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSD2O96028 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms