Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYF2O95926 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYF2O95926 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms