Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX58O95786 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX58O95786 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX58O95786 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX58O95786 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX58O95786 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX58O95786 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX58O95786 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX58O95786 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX58O95786 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms