Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG7O95352 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG7O95352 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATG7O95352 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATG7O95352 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG7O95352 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG7O95352 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG7O95352 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG7O95352 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG7O95352 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG7O95352 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG7O95352 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG7O95352 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG7O95352 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG7O95352 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG7O95352 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG7O95352 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG7O95352 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG7O95352 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms