Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms