Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP19O94966 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
USP19O94966 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
USP19O94966 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP19O94966 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP19O94966 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP19O94966 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP19O94966 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP19O94966 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP19O94966 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP19O94966 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP19O94966 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP19O94966 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP19O94966 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP19O94966 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP19O94966 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP19O94966 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP19O94966 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP19O94966 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP19O94966 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP19O94966 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP19O94966 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP19O94966 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP19O94966 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP19O94966 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP19O94966 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP19O94966 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP19O94966 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP19O94966 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP19O94966 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms