Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN5O75503 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN5O75503 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms