Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF40AO75400 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms