Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms