Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms