Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms