Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNQ2O43526 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNQ2O43526 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms