Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms