Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF1O43189 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF1O43189 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF1O43189 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms