Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A2O14975 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A2O14975 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A2O14975 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A2O14975 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A2O14975 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A2O14975 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A2O14975 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A2O14975 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A2O14975 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A2O14975 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A2O14975 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms