Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIBO00712 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIBO00712 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFIBO00712 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFIBO00712 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFIBO00712 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIBO00712 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIBO00712 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIBO00712 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIBO00712 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIBO00712 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIBO00712 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIBO00712 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIBO00712 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIBO00712 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIBO00712 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIBO00712 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIBO00712 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIBO00712 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIBO00712 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIBO00712 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms