Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms