Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms