Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms