Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms