Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LAMB4A4D0S4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms