Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC78A2IDD5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms