Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MS4A6A-208ENST00000528851 1806 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL023653.1-201ENST00000432513 326 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC099344.1-201ENST00000433548 492 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC239859.3-201ENST00000456469 408 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC084878.1-201ENST00000480555 648 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LINC02517-201ENST00000509453 492 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP14-201ENST00000516000 329 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 IGHVII-1-1-201ENST00000517907 180 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 IGKV2D-14-201ENST00000522473 355 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RN7SL353P-201ENST00000579902 252 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL359745.1-201ENST00000626943 760 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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ANKRD39Q53RE8 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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ANKRD39Q53RE8 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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ANKRD39Q53RE8 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MIRLET7E-201ENST00000362102 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP50-201ENST00000364694 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MT-TS1-201ENST00000387416 69 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TRAV8-6-201ENST00000390443 561 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP256-201ENST00000390978 113 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 NXNP1-201ENST00000397383 1051 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL512430.3-201ENST00000405355 441 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP39-201ENST00000410773 322 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 VN2R10P-201ENST00000411871 853 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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