Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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FOXE3Q13461 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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FOXE3Q13461 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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