Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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