Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms