Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms