Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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