Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms