Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PSMD6Q15008 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms