Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC123788.1-201ENST00000526922 783 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 ECM2-201ENST00000344604 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 RNF214-206ENST00000531452 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 CACYBP-209ENST00000613570 2835 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 NR2F1-AS1-208ENST00000606233 2264 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 MAP9-201ENST00000311277 7333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 INSIG2-201ENST00000245787 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 GMDS-AS1-202ENST00000505870 8217 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 CDH18-203ENST00000502796 2386 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 U3.34-201ENST00000408198 212 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AL031733.1-201ENST00000422817 455 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AL365436.1-201ENST00000452587 495 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC136604.3-202ENST00000514793 485 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC011444.4-201ENST00000586415 418 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC026468.1-201ENST00000614981 107 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.42-201ENST00000621081 348 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC004947.1-201ENST00000420912 2781 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 MTERF4-222ENST00000614476 4524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 ZNF655-213ENST00000425063 4624 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 C4BPA-201ENST00000367070 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 TBX22-202ENST00000373296 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC007126.1-201ENST00000508202 4781 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC024132.1-201ENST00000382007 2509 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 CD86-201ENST00000264468 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 PARP9-205ENST00000477522 3128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 ARMC3-202ENST00000376528 3258 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 LY75-CD302-201ENST00000504764 5650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 MMGT1-201ENST00000305963 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 OR1G1-201ENST00000328890 998 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 GJC1-201ENST00000330514 3295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 EYA4-201ENST00000355167 5692 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 RAB27A-202ENST00000396307 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 TMSB10P1-201ENST00000415070 132 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 Z99943.2-201ENST00000507585 266 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 HSD3BP4-201ENST00000511509 1120 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 AC060765.1-202ENST00000518367 257 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CACNB1Q02641 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.1 ms