Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 CYP4A44P-201ENST00000569984 154 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 SCMH1-210ENST00000402904 3204 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 HOXA1-201ENST00000343060 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRHP20396 TRPS1-208ENST00000519076 3329 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 RECQL5-203ENST00000420326 3710 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 RN7SKP2-201ENST00000517003 319 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 OR51E1-202ENST00000530215 2942 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 GP2-201ENST00000302555 3406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 NUDCD1-201ENST00000239690 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.8 ms