Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms