Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms