Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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CCDC142Q17RM4 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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CCDC142Q17RM4 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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CCDC142Q17RM4 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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CCDC142Q17RM4 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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CCDC142Q17RM4 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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CCDC142Q17RM4 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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CCDC142Q17RM4 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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