Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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