Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AL591926.2-201ENST00000611780 500 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AL121890.4-201ENST00000616569 609 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MAPK10-202ENST00000359221 2668 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGAP36-206ENST00000639280 2685 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PIGO-203ENST00000378617 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MAPRE2-204ENST00000538170 4093 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF700-203ENST00000622593 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC111182.1-201ENST00000588701 3419 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC6A3-201ENST00000270349 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TP63-202ENST00000320472 2032 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TAF1C-203ENST00000541676 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RIPOR1-205ENST00000540839 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NUDCD2-201ENST00000302764 8005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 EPB41-207ENST00000373800 2853 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AKAP4-202ENST00000376064 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 XRCC6-206ENST00000428575 2148 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 COMMD9-201ENST00000263401 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MPI-202ENST00000352410 5828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KXD1-217ENST00000602094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC092132.2-201ENST00000611227 2744 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GLDN-202ENST00000396399 4584 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PADI1-201ENST00000375471 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ADAM9-209ENST00000487273 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NEDD9-201ENST00000379433 3341 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GART-203ENST00000381815 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 BCAS1-202ENST00000395961 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NBPF1-204ENST00000432949 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF226-202ENST00000337433 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MAGI1-IT1-201ENST00000460754 2567 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 IL10RA-201ENST00000227752 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 BCAS3-222ENST00000589222 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GGA3-213ENST00000582486 2319 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ITGB8-205ENST00000537992 3420 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF507-202ENST00000355898 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RHOXF2-201ENST00000371388 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PLA2G2D-201ENST00000375105 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GJC1-201ENST00000330514 3295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RPRD1B-201ENST00000373433 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 USP53-201ENST00000274030 5936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 WDR76-201ENST00000263795 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RP2-201ENST00000218340 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PPP1R26P3-201ENST00000612861 3800 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TNC-201ENST00000341037 6786 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms