Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
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PTPRBP23467 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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