Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms