Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARFGEF1Q9Y6D6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms