Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2L3Q9Y4A8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms