Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN4Q9Y3Q4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms