Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms