Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms