Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZMYND8Q9ULU4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms