Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DENND2AQ9ULE3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms