Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPRSS11EQ9UL52 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPRSS11EQ9UL52 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPRSS11EQ9UL52 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPRSS11EQ9UL52 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPRSS11EQ9UL52 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPRSS11EQ9UL52 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPRSS11EQ9UL52 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPRSS11EQ9UL52 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMPRSS11EQ9UL52 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms