Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MID2Q9UJV3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MID2Q9UJV3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MID2Q9UJV3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MID2Q9UJV3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MID2Q9UJV3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MID2Q9UJV3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MID2Q9UJV3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MID2Q9UJV3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms